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抑郁症患者脑组织转录组基因表达谱的整合分析

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作者:

张珊,陈巍,李丽,赵静洁

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摘要:

目的分析抑郁症患者较健康人各脑区转录组基因的差异表达情况.方法在基因表达谱数据库(gene expression omnibus,GEO)中搜索抑郁症病例-对照设计并含有原始数据的研究,设定物种为人.以各数据集所有转录组基因为观察变量,利用在线软件Network Analyst进行主成分分析(principal component analysis,PCA),整体评估抑郁症患者各个脑区(包括前额叶,前扣带回,杏仁核,海马)相对正常人各脑区的转录组改变差异的程度.利用limma算法分别筛选倍数变化为1.2倍,1.5倍,2.0倍的差异基因(differentially expressed gene,DEG),P

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